撒哈拉以南非洲地区地形复杂多样，呈现出显著的地理分异特征。从宏观尺度来看，该区域以高原为主体，平均海拔约650米，素有"高原大陆"之称。东非高原和南非高原构成主要骨架，其中埃塞俄比亚高原海拔超过2000米，被称为"非洲屋脊"。
断裂地貌是该区域最突出的地形特征之一。东非大裂谷纵贯南北，全长约6400公里，形成一系列串珠状湖泊和火山群。乞力马扎罗山、肯尼亚山等著名火山锥均分布于此，其中乞力马扎罗山海拔5895米，为非洲最高点。裂谷带两侧陡峭的断层崖与谷底平坦的湖盆形成强烈对比。
沿海地带地形差异显著。东南部海岸线平直，受德拉肯斯山脉抬升影响，形成陡峭的断层海岸。西部几内亚湾沿岸则发育冲积平原和三角洲，尼日尔河三角洲面积达2.4万平方公里。马达加斯加岛作为大陆岛，中央高原与沿海狭窄平原形成阶梯状过渡。
水系分布呈现明显不对称性。刚果河流域拥有世界第二大热带雨林，水系呈典型的向心状结构。赞比西河、尼日尔河等大河多发育瀑布和急流，维多利亚瀑布落差达108米。乍得盆地作为内流区，水位变化显著，近年呈现萎缩趋势。
地形对气候和生态系统产生深远影响。高原边缘的陡坡形成降雨屏障，导致纳米布沙漠等沿海干旱区。刚果盆地因地势低洼形成持续湿润气候，而东非高原则因海拔较高形成热带草原气候。这种地形-气候耦合效应造就了非洲独特的生物多样性分布格局。
